Цитировать Яндекса не хочу, но вам обязательно стоит почитать данный небольшой отчет, чтобы напугать себя и заставить предпринять некоторые меры, ну например воспользоваться моим простым сервисом jAntivirus. Я уж не говорю о каких-нибудь бешеных решениях, которые позволят контроллировать даже ломаные линки.
Вообщем читайте Яндекса, Safe Search: Активность злоумышленников при распространении вредоносного кода за 2012 год
Кстати ребяты из Яндекса пишут что добавив сайт в Вебмастера — панацея. Это вовсе не так. Это панацея от популярный вирей, а вот от простого взлома — это не спасет.